מכון על משמר הכנסת מסייע להגשים את ערכי השקיפות והאחריותיות באמצעות מרכז מידע אינטרנטי שמשתף את הציבור בעמדותיהם העקרוניות, ביוזמותיהם הפרלמנטאריות, בהתבטאויותיהם הציבוריות ובמכלול הצבעותיהם של חברי וחברות הכנסת בנושאי דת ומדינה.

מחלקת החינוך של מכון על משמר הכנסת מציעה שלל פעילויות. סדנאות, הרצאות, סמינרים, סיורים וימי עיון – לפיתוח מודעות ואקטיביזם אזרחיים בנושאי דמוקרטיה, דת ומדינה – לבתי ספר תיכוניים, מכינות, מסגרות ש"ש וסטודנטים, למשלחות, קבוצות מנהיגות וקהילות ישראליות.

למכון על משמר הכנסת צוות מתנדב וצוות מקצועי. יושבת ראש המכון היא אמילי לוי-שוחט, מנהלת חברת ייעוץ לארגוני חברה שלישית. מנהלת המכון היא שרון בניאן, עורכת דין, דוברת התנועה המסורתית לשעבר ובעלת ניסיון בשירות הציבורי . למכון מנהלי מחלקות כנסת, חינוך ואנגלית וצוות מתמחים מתנדבים מהארץ ומהעולם.